2014年南京大學學術型研究生招生專業163個，專業學位研究生招生類別21個，招生規模暫定3500名，其中學術型研究生2000左右，原則上非定向類別錄取（有特殊說明的除外），專業學位研究生1500名，原則上非定向、定向培養類別錄取，完成學業后，可以獲得畢業證書和學位證書。

南京大學參加教育部等五部委組織實施的培養少數民族高層次骨干人才計劃，計劃招收65名碩士生。按照“定向招生、定向培養、定向就業”的要求，采取“自愿報考、統一考試、適當降分、單獨劃線”等特殊措施招收學生，少數民族考生和漢族考生將分別劃線，漢族考生錄取人數不能超過當年少數民族高層次骨干人才計劃錄取人數的10%。

據悉，南京大學對所有納入全國研究生招生計劃的新入學研究生設立“助學金”，每年6000元/人；對新入學的優秀碩士研究生，設立“新生獎學金”，最高額度10000元；對二、三年級碩士研究生，按一定比例設立“學業獎學金”，額度5000元；在碩士研究生中，教育部設有“國家獎學金”，額度20000元；此外，學校還設有冠名獎學金和“助教、助研、研管”崗位。